Depolamada büyük sorunlar yaratan ürünün kısa sürede bozulması, ortamın zararlı bakterilerden tamamen arıtılmamasından,  ürün üzerinde kalmasından yada  havada bulunmasından kaynaklanmaktadır. Ozonu depo içerisine gaz olarak vererek ortamda bulunan raf, alet, duvar, tavan gibi bölümlerde, ürün üzerinde bulunan bölümlerde ve havada bulunun bakterilerin,  gelişmesi engellenmekte ve öldürülmektedir.

Depolarda çalışan ve depoların içerisine giren personelin steril olması girişte personelin el ve ayaklarının ozonla dezenfekte olması alınacak önlemlerle mümkün olmaktadır. Bunun sonucunda ürünün raf ömrü çok daha fazla uzar, ürünler arası kokunun birbirine karışması engellenir, ürünün renginde değişim olmaz, taze kalması sağlanacağından sağlıklı ve kaliteli depolama sağlanmış olur

Aşağıda ozon uygulanmış ve uygulanmamış bazı ürünlerin üzerindeki dijital ortamdaki bakteri, küf mantar görüntüleri: